Un mode de reproduction semi-autogame

Les ovules sont généralement fertilisés par autopollinisation. Un taux d'allofécondation de 10 à 30 % est estimé et varie selon les variétés. Le pollen, lourd et collant, ne peut être porté par le vent à une grande distance. Il peut être transporté par les insectes, et principalement par les abeilles, la fleur de colza étant très attractive.

Ses quatre nectaires sécrètent 0,2 à 2 mg par jour un abondant nectar contenant de 40 à 60 % de sucres ce qui en fait, grâce à l'étendue de sa culture et à la durée de sa floraison, une des plantes nectarifères et pollenifères de première importance avec le tournesol.
Dans le cas de plantes situées à proximité l'une de l'autre, la pollinisation croisée peut également résulter du contact entre les grappes de fleurs.

Des inflorescences en grappes simples
à croissance indéfinie

Les boutons floraux pédonculés s'épanouissent de bas en haut. Les fleurs sont régulières et composées d'un calice à 4 sépales libres et d'une corolle composée de 4 pétales libres jaunes disposés en croix d'où le nom de crucifère.