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Jusqu'à présent, le sélectionneur abordait la diversité génétique en ne tenant compte que des caractères observables. Il est dorénavant possible, grâce à des techniques de biologie moléculaire, de lire partiellement le génotype d'un individu, et d'étudier la diversité génétique au niveau du génome.
Aujourd'hui, avec le marquage moléculaire, de nouvelles perspectives s'ouvrent pour le sélectionneur.
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